無細胞蛋白表達技術是一種先進的體外重組蛋白質表達技術,是利用含有蛋白質合成必需組分的細胞裂解物,在體外條件下進行蛋白質合成的過程。這些必需組分通常包括核糖體、轉運RNA(tRNA)、氨酰合成酶、啟動/延伸/終止因子、三磷酸鳥苷(GTP)、ATP、Mg2+和K+等。該技術通過在體外模擬細胞內的蛋白質合成環境,實現了不依賴于完整細胞體系的蛋白質生產。
無細胞蛋白表達技術是一種在體外模擬蛋白質合成過程的技術,不依賴完整的細胞結構。以下是使用該技術時需要注意的一些關鍵事項:
一、模板DNA方面
純度要求
模板DNA的純度對無細胞蛋白表達至關重要。如果模板DNA含有雜質,如蛋白質、RNA、有機溶劑等,可能會干擾無細胞翻譯系統的反應過程。例如,殘留的蛋白質可能會與無細胞系統中的酶競爭底物,或者影響酶的活性。一般要求模板DNA的純度達到較高的標準,A260/A280比值通常在1.8-2.0之間,以確保模板DNA的質量。
需要通過合適的純化方法,如酚-氯仿抽提、乙醇沉淀等,去除雜質,以獲得高質量的模板DNA用于后續的無細胞表達。
濃度優化
模板DNA的濃度需要合理調整。濃度過低可能導致蛋白質產量低,因為參與翻譯的模板數量有限;而濃度過高則可能會引起模板之間的相互干擾,或者使反應體系的黏度增加,影響物質的擴散和反應效率。
不同的無細胞表達系統對模板DNA的優濃度要求不同,一般需要通過預實驗來確定。例如,對于某些基于大腸桿菌裂解物的無細胞表達系統,模板DNA的濃度可能在50-200 ng/μL之間較為合適。
二、原料供應方面
氨基酸供應
確保無細胞系統中有足夠且平衡的各種氨基酸是關鍵。缺乏任何一種必需氨基酸都會導致蛋白質合成不完整或產量降低。
有些特殊的氨基酸,如硒代半胱氨酸,在某些蛋白質的合成中是必需的,但在常規的氨基酸混合物中可能不存在,這時需要另外添加。同時,氨基酸的濃度也會影響蛋白質表達,過高的氨基酸濃度可能會抑制反應,因此需要根據具體的表達系統和蛋白質進行優化。
能量物質供應
無細胞蛋白表達需要能量物質來驅動反應,通常是三磷酸腺苷(ATP)和還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)。ATP為蛋白質合成提供能量,包括肽鍵的形成、氨基酸的激活等過程都需要ATP參與。NADPH主要參與一些需要還原環境的步驟,如二硫鍵的形成等。
這些能量物質的濃度需要維持在合適的水平。如果ATP濃度過低,蛋白質合成會因為能量不足而受阻;如果濃度過高,可能會導致系統的滲透壓改變,影響反應的正常進行。一般會根據無細胞系統的特性和反應規模來確定能量物質的添加量。
三、反應條件控制方面
溫度控制
溫度對無細胞蛋白表達中的酶活性有顯著影響。不同的酶在無細胞系統中有其最適反應溫度。一般來說,無細胞表達系統的反應溫度在室溫(20-25°C)到37°C之間。溫度過低,酶的活性會降低,蛋白質合成速度變慢;溫度過高則可能導致酶變性失活。
例如,對于一些來源于大腸桿菌的無細胞表達系統,37°C可能是比較合適的溫度,但這個溫度也可能會加速系統的蒸發和成分的降解,所以需要在反應過程中通過合適的設備(如恒溫水浴、金屬加熱塊等)精確控制溫度。
pH值控制
pH值會影響蛋白質的電荷狀態和酶的活性。無細胞蛋白表達系統通常有一個最適pH范圍,一般在7.0-8.5之間。不適當的pH值可能會導致氨基酸的離子化狀態改變,影響翻譯過程中的氨基酸活化和肽鏈延伸。
同時,pH值的變化還會影響無細胞系統中各種酶的活性,例如,負責蛋白質折疊的分子伴侶在不適當的pH條件下可能無法正常發揮功能??梢酝ㄟ^添加緩沖液(如Tris-HCl、HEPES等)來維持反應體系的pH穩定。
離子強度控制
離子強度對無細胞蛋白表達也有重要影響。合適的離子強度可以維持蛋白質和核酸的結構穩定性,促進酶與底物的結合。
過高的離子強度可能會屏蔽分子間的電荷相互作用,干擾反應;過低的離子強度則可能導致蛋白質和核酸的聚集或沉淀。通常通過添加適量的鹽(如氯h鉀、氯化鈉等)來調節離子強度,使其適應無細胞表達系統的要求。
四、抑制因素方面
內源核酸酶抑制
無細胞系統中可能存在內源核酸酶,這些核酸酶會降解模板DNA和mRNA,從而降低蛋白質表達的效率。為了防止這種情況,需要添加核酸酶抑制劑,如RNasin(用于抑制RNA酶)和某種DNA酶抑制劑。
不同的無細胞系統可能需要不同類型和濃度的核酸酶抑制劑。例如,在一些植物無細胞表達系統中,由于植物組織本身含有較多的RNA酶,可能需要添加較高濃度的RNasin來有效抑制RNA降解。
蛋白酶抑制
無細胞系統中也可能含有蛋白酶,這些蛋白酶會降解新合成的蛋白質。添加蛋白酶抑制劑(如苯j基磺酰氟(PMSF)、乙二胺四乙酸(EDTA)等)可以保護目標蛋白質不被降解。
但是,蛋白酶抑制劑的使用需要謹慎,因為某些抑制劑可能會對無細胞系統中的酶產生非特異性抑制。在選擇蛋白酶抑制劑時,需要考慮其特異性和對無細胞系統的兼容性。